Tekutá biopsie · Kompaktní panel

HP2 — panel 32 genů pro tekutou biopsii

Hedera Profiling 2 je kompaktní test z tekuté biopsie pro nejčastější solidní nádory — plíce, prs, tlusté střevo, prostatu i další. Jeho 32 genů pokrývá přes 80 % doporučení ESCAT Level I, včetně ESR1, MET ex14 a stavu MSI. Hybrid-capture s UMI drží vysokou citlivost i u variant s nízkým podílem.

  • 32 Genů v panelu
  • 10 ng Minimální vstup cfDNA
  • 5 dní Od vzorku po klinický report
  • 0,5 % Detekční limit
O testu

Kompaktní ctDNA panel pro nejčastější solidní nádory

HP2 stojí na jednoduchém principu: menší panel, který obsahuje jen to podstatné. Vybrané geny pokrývají rozhodnutí o léčbě u nádorů, které ESMO doporučuje testovat z ctDNA. Díky tomu má jen 90 kb a sekvenace vyjde levněji.

Klíčové markery pro volbu léčby v panelu zůstávají: ESR1 pro hormonální rezistenci u karcinomu prsu, MET ex14 skipping u karcinomu plic a stav MSI pro imunoterapii. Všechno v jednom protokolu s korekcí chyb pomocí UMI.

Specifikace

Co HP2 panel zvládne v jednom testu

32 genů, 90 kb

Kompaktní panel vyvážený mezi klinicky nejdůležitějšími geny a cenou sekvenace.

> 80 % ESCAT Level I

Pokrývá přes 80 % genů ESCAT Level I.

SNV, indely a CNV

Bodové mutace, malé indely a změny počtu kopií. K tomu detekce fúzí přímo z ctDNA a stav MSI.

ESR1, MET ex14, MSI

Markery, které rozhodují o léčbě: hormonální rezistence u karcinomu prsu, MET skipping u karcinomu plic a MSI pro checkpoint inhibitory.

UMI

Molekulární identifikátory opravují chyby čtení. Výsledkem je vyšší přesnost u variant s nízkým podílem.

10 ng cfDNA z 5 ml plazmy

Minimální vstup 10 ng, doporučeno 30 ng. Odběr do zkumavek Streck cfDNA BCT.

Obsah panelu

Kompletní seznam genů v panelu

Podle originální specifikace Hedera Dx. Panel navíc pokrývá METex14 skipping a variantu EGFR vIII. Stanovení MSI staví na 36 markerech. Metoda detekce CNV je ve validaci.

Seznam genů panelu HP2 rozdělený na SNV a indely, CNV, fúze a MSI
Postup

Od vzorku po report za 5 dní

Celý postup proběhne u vás v laboratoři. Hedera Dx dodává kit, protokol pro přípravu knihovny, hybrid-capture i software Hedera Prime. Výstupem je klinický report pro onkologa nebo molekulárního patologa.

  1. 1

    Odběr krve a izolace cfDNA

    5 ml plazmy ze zkumavky Streck cfDNA BCT. Do přípravy knihovny vstupuje minimálně 10 ng cfDNA, doporučeno 30 ng.

  2. 2

    Příprava knihovny s UMI

    Technologie Twist Bioscience. Využívá UMI pro zvýšení přesnosti detekce nízkofrekvenčních variant. Běží na běžném vybavení laboratoře, není potřeba nic dokupovat.

  3. 3

    Hybrid-capture

    Hybrid-capture na 32 genů (90 kb), včetně detekce fúzí přímo z DNA.

  4. 4

    Sekvenace

    Panel běží na běžných sekvenátorech Illumina a Element Biosciences.

  5. 5

    Report v Hedera Prime

    Kompletní vyhodnocení dat až po klinický report. Závěrečná analýza trvá do pěti minut.

Implementační podpora

Hedera Comply — zavedení podle IVDR na míru

K HP2 patří program Hedera Comply. Provede vaši laboratoř celou cestou od instalace až po provoz podle IVDR.

  • Praktické zaškolení přímo u vás v laboratoři
  • Laboratorní postupy i zaškolení na software
  • Vyhodnocení prvních běhů a validace
  • Připravená technická dokumentace pro IVDR
  • Průběžná podpora i po zavedení
Pojďme začít

Chcete HP2 ve své laboratoři?

Projdeme s vámi technické požadavky, parametry vzorků i používání softwaru Hedera Prime. Můžeme vám nabídnout kit na vyzkoušení za výhodných podmínek.