Výtěžnost nad 70 %
Řízení napětí v každém kanálu drží výtěžnost vybraných fragmentů nad 70 %.
Ranger® Technology · výběr fragmentů DNA
Yourgene Health — automatický výběr fragmentů DNA podle velikosti
Přístroje Yourgene Health s technologií Ranger® automatizují gelovou elektroforézu. Vybírají fragmenty DNA podle velikosti, měří jejich délku a kvantifikují DNA fluorometricky. V jejich portfoliu mají tři přístroje: LightBench®, LightBench® Discover a NIMBUS Select.
- >70 % Výtěžnost vybraných fragmentů
- 97 % Opakovatelná přesnost výběru
- <35 µl Objem vzorku DNA
- až 96 Vzorků v jednom běhu
O společnosti
Výběr fragmentů bez vyřezávání z gelu
Yourgene Health používá technologii Ranger® v přístrojích pro výběr fragmentů DNA podle velikosti. Nahrazuje ruční postup, kdy se gel odlévá, vzorky se nanášejí, po elektroforéze se z gelu vyřízne blok s cílovými fragmenty a DNA se z něj izoluje.
Kromě výběru fragmentů přístroje měří délku fragmentů a kvantifikují DNA fluorometricky. Slouží proto i ke kontrole kvality před sekvenováním nové generace (NGS). Používají se v NIPT, onkologii, syntéze genů a u sekvenování dlouhých čtení.
Technologie
Ranger® — elektroforéza řízená inteligentní analýzou obrazu
Ranger® dělí molekuly DNA v gelu podle velikosti a náboje. Kamera snímá průběh elektroforézy v reálném čase. Patentované algoritmy dokáží z obrazu vyhodnotit, kde se cílové fragmenty právě nacházejí.
Podle toho přístroj upravuje napětí v každém kanálu zvlášť. Cílové fragmenty tak dorazí do extrakčních jamek ve všech kanálech současně. Dva referenční markery velikosti se volí podle cílové velikosti fragmentů.
Koncentrovaná DNA
Vybraná DNA se odebírá v objemu pod 35 µl. Pro navazující kroky ji máte ve vysoké koncentraci.
Přesnost 97 %
Dva referenční markery zvolené podle cílové velikosti dávají opakovatelnou přesnost výběru 97 %.
Tři funkce v jednom
Výběr fragmentů podle velikosti, analýza délky fragmentů a fluorometrická kvantifikace na jednom přístroji.
Běží bez dozoru
Odpadá odlévání gelů, vyřezávání a izolace DNA z gelu. Technik vzorky nanese a přístroj pracuje sám.
Napojení na automatizaci
LightBench® má rozhraní API. Lze ho zapojit do pipetovacích systémů jiných výrobců.
Přístroje
Tři přístroje s technologií Ranger®
LightBench®
Kompaktní přístroj pro výzkumné laboratoře. Vybírá fragmenty podle velikosti až z 12 vzorků v jednom běhu, měří délku fragmentů a kvantifikuje DNA. Kazety lze osadit markery podle cílové velikosti.
- Výběr fragmentů
- 0–20 kb+, až 12 vzorků, 1–4 h
- Analýza fragmentů
- 50 bp – 20 kb+, 24–48 vzorků, 20–40 min
- Kvantifikace
- detekční limit 0,2 ng, přesnost ±15 %
- Výtěžnost
- 70–80 %
- Rozměry
- 32,5 × 42,4 × 38,1 cm, 20,5 kg
LightBench® Discover
Přístroj pro velké fragmenty DNA. Díky elektroforéze s inverzním pulzním polem změří délku fragmentů až do 150 kb za méně než 2 hodiny. Má dva přednastavené protokoly: 3–75 kb a 20–150 kb pro velmi dlouhou DNA. Perfektní pro uživatele PacBio sekvenátorů. Software Ranger Analytics vyhodnotí průměrnou velikost fragmentů, čistotu a kvalitu vzorku (Sample Quality Number, SQN).
- Výběr fragmentů
- 0–20 kb+, 1–12 vzorků, 1–4 h
- Analýza fragmentů
- 50 bp – 150 kb; do 20 kb až 48 vzorků, nad 20 kb 20 vzorků za 110 min
- Kvantifikace
- 1–384 vzorků na destičce, pod 30 min
- Citlivost
- 10 ng u směsi fragmentů, 0,5 ng u jednotlivých proužků
- Rozměry
- 32,5 × 42,4 × 38,1 cm, 20,5 kg
NIMBUS Select
Pracovní stanice pro laboratoře s velkým počtem vzorků, vyvinutá ve spolupráci s Hamilton Robotics. Automatizuje celý postup: smíchání vzorků s nanášecím pufrem, nanesení do kazet, řízení elektroforézy i odběr vybrané DNA. Vzorky lze přidávat i po spuštění běhu a výsledky předat do LIMS.
- Výběr fragmentů
- 0–20 kb, až 96 vzorků, 1–4 h
- Analýza fragmentů
- 50 bp – 20 kb, 192–384 vzorků, 20–40 min
- Kvantifikace
- detekční limit 0,2 ng, přesnost ±15 %
- Výtěžnost
- průměrně nad 70 %
- Rozměry
- 134 × 75 × 88 cm, 101,2 kg
Srovnání
Který přístroj se hodí pro vaši laboratoř
Přehled aplikací, funkcí a kapacity podle srovnávací tabulky Yourgene Health.
| LightBench® Výzkumné aplikace (RUO) | LightBench® Discover Analýza velkých fragmentů | NIMBUS Select Vysoká kapacita | |
|---|---|---|---|
| Aplikace | |||
| NIPT | |||
| Onkologie | |||
| Syntéza genů | |||
| Sekvenování dlouhých čtení | – | – | |
| Funkce | |||
| Výběr fragmentů podle velikosti | |||
| Analýza délky fragmentů | |||
| Fluorometrická kvantifikace | |||
| Kapacita | |||
| Vzorků v jednom běhu | 12 | 12 | 96 |
Aplikace
Kde se Ranger® používá
NIPT
Fetální cfDNA je kratší (typicky pod 140 bp) než mateřská cfDNA (typicky nad 150 bp). Výběrem podle velikosti lze podíl fetální DNA zvýšit nejméně dvojnásobně.
Onkologie
Výběr fragmentů cfDNA v cílové velikosti pro tekuté biopsie a přípravu NGS knihoven.
Syntéza genů
Výběr podle velikosti odstraní zkrácené produkty syntézy. Zůstane jen konstrukt DNA v plné délce.
Sekvenování dlouhých čtení
Odstranění krátkých fragmentů, které by na čipu zbytečně obsadily místa detekce. Yourgene Health je PacBio Compatible Partner.
Pojďme začít
Zajímají vás Ranger® přístroje pro vaši laboratoř?
Pomůžeme vybrat přístroj podle počtu vzorků, velikosti fragmentů a navazující aplikace. Spojte se s námi, rádi vám poradíme.