43 genů
Geny s klinicky významnými přestavbami a expresními markery.
RNA panel · Fúze a exprese
Hedera Profiling RNA — panel 43 genů pro fúze a expresi
Hedera Profiling RNA doplňuje DNA panely tam, kde je potřeba pracovat s transkriptem. Zachytí genové fúze nezávisle na fúzním partnerovi, sestřihové varianty i klinicky významný exonový skipping. Vedle přestaveb profiluje také genovou expresi.
- 43 Genů v panelu
- RNA Typ vzorku
- Fúze Nezávisle na fúzním partnerovi
- Exony Próby na hranicích exonů
O testu
RNA panel pro fúze a sestřihové varianty
Část klinicky významných přestaveb se z DNA hledá obtížně. Zlom leží v dlouhém intronu nebo je fúzní partner neznámý. Hedera Profiling RNA jde na ně z druhé strany — pracuje s transkriptem, kde je fúze vidět jako spojení dvou exonů.
Próby jsou umístěné na hranicích exonů napříč všemi kódujícími exony vybraných genů. Panel proto zachytí fúzi bez ohledu na fúzního partnera a odliší jednotlivé izoformy. Vedle fúzí čte expresní profil a sestřihové varianty včetně exonového skippingu.
Specifikace
Co HP RNA panel zvládne v jednom testu
Fúze bez známého partnera
Próby na hranicích exonů zachytí fúzi nezávisle na tom, s čím gen fúzoval.
Sestřihové varianty
Panel odliší izoformy a zachytí klinicky významný exonový skipping.
Profilování exprese
Vedle přestaveb čte i expresní profil zahrnutých genů.
Technologie Twist Bioscience
Hybrid-capture na běžném vybavení laboratoře, není potřeba nic dokupovat.
Software Hedera Prime
Vyhodnocení dat i reporting na jednom místě — od sekundární analýzy po klinický report.
Obsah panelu
Kompletní seznam genů v panelu
Podle originální specifikace Hedera Dx. Geny vyznačené tmavě mají próby na hranicích exonů napříč všemi kódujícími exony — u nich panel zachytí fúzi nezávisle na fúzním partnerovi.
Postup
Od vzorku po klinický report
Celý postup proběhne u vás v laboratoři. Hedera Dx dodává kit, protokol i software Hedera Prime. Výstupem je klinický report pro onkologa nebo molekulárního patologa.
- 1
Izolace RNA
Ze vzorku se izoluje celková RNA.
- 2
Přepis do cDNA a knihovna
Technologie Twist Bioscience. Běží na běžném vybavení laboratoře, není potřeba nic dokupovat.
- 3
Hybrid-capture
Hybrid-capture na 43 genů s próbami cílenými na hranice exonů.
- 4
Sekvenace
Panel běží na běžných sekvenátorech Illumina a Element Biosciences.
- 5
Report v Hedera Prime
Kompletní vyhodnocení dat až po klinický report.
Implementační podpora
Hedera Comply — zavedení podle IVDR na míru
K panelu patří program Hedera Comply. Provede vaši laboratoř celou cestou od instalace až po provoz podle IVDR.
- Praktické zaškolení přímo u vás v laboratoři
- Laboratorní postupy i zaškolení na software
- Vyhodnocení prvních běhů a validace
- Připravená technická dokumentace pro IVDR
- Průběžná podpora i po zavedení
Pojďme začít
Chcete HP RNA ve své laboratoři?
Projdeme s vámi technické požadavky, parametry vzorků i používání softwaru Hedera Prime. Můžeme vám nabídnout kit na vyzkoušení za výhodných podmínek.