115 genů
Panel pokrývá geny, které rozhodují o léčbě nejčastějších solidních nádorů.
Profilování nádorů z DNA · Tkáň i plazma
HP1 — panel 115 genů z tkáně i z krve
Hedera Profiling 1 je NGS panel pro nejčastější solidní nádory. Jedná se o DNA panel a zvládne dva typy vzorku — nádorovou tkáň z FFPE bloku i ctDNA z plazmy. Postup je v obou případech stejný. Panel pokrývá 100 % cílů ESCAT Level I a všechny geny doporučené v NCCN guidelines.
- 115 Genů v panelu
- 2 typy Vzorku — tkáň i plazma
- 5 dní Od vzorku po klinický report
- 0,5 % Detekční limit
O testu
Jeden panel pro tkáň i krev
HP1 je navržený tak, aby stejný postup fungoval na FFPE tkáni i na cirkulující nádorové DNA. Laboratoř nemusí udržovat dva samostatné protokoly. Liší se jen vstupní materiál — příprava knihovny, sekvenace i reporting jsou identické.
V jednom testu HP1 zachytí SNV, indely, CNV i fúze. Fúze detekuje patentovanou technologií přímo z DNA. Součástí panelu je také MSI.
Specifikace
Co HP1 panel zvládne v jednom testu
100 % ESCAT Level I
Panel pokrývá všechny cíle ESCAT Level I i geny doporučené v NCCN guidelines.
Tkáň i plazma
Stejný postup pro tkáňový vzorek i pro tekutou biopsii.
Fúze přímo z DNA
Panel dokáže zachytit genové fúze na úrovni DNA.
Vstup od 10 ng DNA (cfDNA)
Nízký vstup zvládne práci s plazmou (od 10 ng) i s malými biopsiemi (od 30 ng). Funguje s běžnými izolačními kity.
Software Hedera Prime
Vyhodnocení dat i reporting na jednom místě — od sekundární analýzy po klinický report. Závěrečná analýza trvá do pěti minut.
Obsah panelu
Kompletní seznam genů v panelu
Podle originální specifikace Hedera Dx. Geny vyznačené tmavě jsou pokryté v celé kódující sekvenci (Full CDS). Stanovení MSI staví na 119 markerech.
Postup
Od vzorku po report za 5 dní
Celý postup proběhne u vás v laboratoři. Hedera Dx dodává kit, protokol pro přípravu knihovny, hybrid-capture i software Hedera Prime. Výstupem je klinický report pro onkologa nebo molekulárního patologa.
- 1
Izolace DNA
Z FFPE tkáně nebo z plazmy. Do přípravy knihovny vstupuje minimálně 30 ng DNA z FFPE a 10 ng DNA z cfDNA.
- 2
Příprava knihovny s UMI
Technologie Twist Bioscience. Využívá UMI pro zvýšení přesnosti detekce nízkofrekvenčních variant. Běží na běžném vybavení laboratoře, není potřeba nic dokupovat.
- 3
Hybrid-capture
Hybrid-capture na 115 genů, včetně detekce fúzí přímo z DNA.
- 4
Sekvenace
Panel běží na běžných sekvenátorech Illumina a Element Biosciences.
- 5
Report v Hedera Prime
Kompletní vyhodnocení dat až po klinický report. Závěrečná analýza trvá do pěti minut.
Implementační podpora
Hedera Comply — cesta k provozu podle IVDR
K HP1 můžete využít program Hedera Comply. Provede vaši laboratoř lokální validací i přechodem na provoz podle IVDR. Zahrnuje zaškolení týmu přímo u vás, technickou dokumentaci a průběžnou podporu aplikačních specialistů Hedera Dx.
Validaci a dokumentaci tak nemusíte řešit vlastními silami — dostanete hotový postup, který stačí projít.
- Lokální validace v jasných krocích
- Zaškolení laboratorního i vyhodnocovacího týmu u vás
- Technická dokumentace pro spis podle IVDR
- Průběžná podpora aplikačních specialistů
Pojďme začít
Chcete HP1 ve své laboratoři?
Projdeme s vámi technické požadavky, parametry vzorků i používání softwaru Hedera Prime. Můžeme vám nabídnout kit na vyzkoušení za výhodných podmínek.