43 genů, 148 kb
Rozšířený panel se 148 kb cíleného obsahu. Postup zůstává stejný jako u HP2.
Tekutá biopsie · Rozšířený panel
HP3 — panel 43 genů pro tekutou biopsii
Hedera Profiling 3 je rozšířená verze testu z tekuté biopsie pro nejčastější solidní nádory — plíce, prs, vaječníky i prostatu. Oproti kompaktnímu HP2 pokrývá víc genů ESCAT Level I (přes 90 %) a 148 kb cíleného obsahu. Hodí se tam, kde potřebujete podrobnější podklad pro volbu léčby nebo pro zařazení pacienta do klinické studie.
- 43 Genů v panelu
- 10 ng Minimální vstup cfDNA
- 5 dní Od vzorku po klinický report
- 0,5 % Detekční limit
O testu
Rozšířený ctDNA panel se širším pokrytím ESCAT L1
HP3 je sesterský panel k HP2 pro situace, kdy 32 genů nestačí. Rozšířený obsah 43 genů (148 kb) pokrývá přes 90 % cílů ESCAT Level I — proti více než 80 % u HP2. Postup od vzorku po report zůstává stejný.
HP3 si zachovává všechny vlastnosti platformy Hedera Profiling: hybrid-capture s korekcí chyb přes UMI, detekci fúzí přímo z DNA bez sekvenace RNA, stanovení stavu MSI i klinický report v softwaru Hedera Prime.
Specifikace
Co HP3 panel zvládne v jednom testu
> 90 % ESCAT Level I
Pokrývá více než 90 % cílů ESCAT Level I — vhodné tam, kde potřebujete širší podklad pro rozhodnutí o léčbě.
SNV, indely, CNV a MSI
Bodové mutace, malé indely, změny počtu kopií i stav MSI — v jednom testu.
Fúze přímo z DNA
Genové fúze zachytí panel přímo z ctDNA. Nepotřebujete druhou knihovnu ani sekvenaci RNA.
UMI
Molekulární identifikátory opravují chyby čtení. Výsledkem je vyšší přesnost u variant s nízkým podílem.
10 ng cfDNA z 5 ml plazmy
Minimální vstup 10 ng, doporučeno 30 ng. Odběr do zkumavek Streck cfDNA BCT.
Obsah panelu
Kompletní seznam genů v panelu
Podle originální specifikace Hedera Dx. Panel navíc pokrývá METex14 skipping a variantu EGFR vIII. Stanovení MSI staví na 36 markerech.
Klinické indikace
Kde vám HP3 pomůže
Karcinom plic (NSCLC)
Kompletní profil z ctDNA — driverové mutace, MET ex14, rezistenční varianty EGFR i fúze.
Karcinom prsu
ESR1 pro hormonální rezistenci, PIK3CA i další markery pro volbu léčby — z jednoho odběru krve.
Karcinom vaječníků
Oproti HP2 pokrývá víc variant, které rozhodují o cílené léčbě.
Karcinom prostaty
Molekulární profil pro cílenou léčbu pokročilého onemocnění. Vhodné i pro průběžné sledování z krve.
Postup
Od vzorku po report za 5 dní
Celý postup proběhne u vás v laboratoři. Hedera Dx dodává kit, protokol pro přípravu knihovny, hybrid-capture i software Hedera Prime. Čistý čas práce technika jsou 3 hodiny, výstupem je klinický report pro onkologa nebo molekulárního patologa.
- 1
Odběr krve a izolace cfDNA
5 ml plazmy ze zkumavky Streck cfDNA BCT. Do přípravy knihovny vstupuje minimálně 10 ng cfDNA, doporučeno 30 ng.
- 2
Příprava knihovny s UMI
Technologie Twist Bioscience. Využívá UMI pro zvýšení přesnosti detekce nízkofrekvenčních variant. Běží na běžném vybavení laboratoře, není potřeba nic dokupovat.
- 3
Hybrid-capture
Hybrid-capture na 43 genů (148 kb), včetně detekce fúzí přímo z DNA.
- 4
Sekvenace
Panel běží na běžných sekvenátorech Illumina a Element Biosciences.
- 5
Report v Hedera Prime
Kompletní vyhodnocení dat až po klinický report. Závěrečná analýza trvá do pěti minut.
Implementační podpora
Hedera Comply — zavedení podle IVDR na míru
K HP3 patří program Hedera Comply. Provede vaši laboratoř celou cestou od instalace až po provoz podle IVDR.
- Praktické zaškolení přímo u vás v laboratoři
- Laboratorní postupy i zaškolení na software
- Vyhodnocení prvních běhů a validace
- Připravená technická dokumentace pro IVDR
- Průběžná podpora i po zavedení
Pojďme začít
Chcete HP3 ve své laboratoři?
Projdeme s vámi technické požadavky, parametry vzorků i používání softwaru Hedera Prime. Můžeme vám nabídnout kit na vyzkoušení za výhodných podmínek.