Detekce ≤ 0,1 % VAF
Příprava knihovny s vysokou konverzí a amplifikace TrueAmp s nízkým zkreslením umožňují citlivou detekci vzácných variant v cfDNA — ideální pro včasný záchyt nádorů i MRD.
Twist Bioscience
Twist cfDNA TrueAmp Kit — knihovna připravená za 2 hodiny
Twist cfDNA Library Preparation kit s unikátní TrueAmp polymerázou je specializovaný kit pro přípravu knihovny z cfDNA. Připravený pro liquid biopsy, MRD monitoring i pan-cancer screening — s detekcí variant ≤ 0,1 % VAF a chybovostí na úrovni knihoven bez PCR.
- < 1 ng Vstupní cfDNA
- 2 h Celkový čas do hotové knihovny
- ≤ 0,1 % Detekční limit VAF pro vzácné varianty
- UMI Plně kompatibilní
O produktu
Příprava knihovny specializovaná na cell-free DNA
Twist cfDNA Library Preparation Kit s TrueAmp polymerázou je optimalizovaný pro fragmentovanou cfDNA s nízkým vstupem. Postup vynechává fragmentační krok a využívá upravenou T4 DNA ligázu s vysokou konverzní efektivitou i TrueAmp polymerázu pro amplifikaci s minimálním zkreslením.
Kit dosahuje chybovosti na úrovni knihoven bez PCR — i přes amplifikační krok. To umožňuje detekci nízkofrekvenčních variant ≤ 0,1 % VAF. Plná kompatibilita s Twist UMI adaptéry.
- Upravená T4 DNA ligáza pro vysokou konverzní efektivitu
- TrueAmp polymeráza — chybovost na úrovni knihoven bez PCR
- Konzistentní velikost fragmentů od 37,5 ng do 300 ng vstupu
- Vyvážený GC obsah — minimalizuje zkreslení v GC extrémech
Hlavní výhody
Pět vlastností, kterými cfDNA TrueAmp Kit vyniká
Kvalita a rychlost
Chybovost substitučních variant odpovídá postupům bez PCR — a to s rychlostí 2hodinového kitu a extrémně nízkou vstupní DNA.
Vyšší výtěžnost knihovny
Konzistentně vyšší výnos než konkurence — i při 15 ng vstupu a standardech 0,25 % VAF.
Duplex sekvenování s UMI
Plná kompatibilita se systémem Twist UMI Adapter pro duplex sekvenování — vysoce citlivá detekce ve složitých aplikacích.
Připraveno pro hybrid capture
Kompatibilní s Twist panely pro cílené obohacení — Oncology DNA CGP, MRD Express i panely na míru. Standardní hybridizační protokol.
Workflow
Od cfDNA po sekvenační analýzu
Twist cfDNA Library Prep Kit pokrývá kroky library prep i hybrid capture — knihovna hotová za 2 hodiny.
01
Sample prep
Izolace cfDNA z plazmy — nevyžaduje další fragmentaci.
02
Library prep
Upravená T4 ligáza + Twist Universal/UMI adaptery. TrueAmp PCR (typicky 6 cyklů).
03
Target enrichment
Hybrid capture s jakýmkoliv hotovým nebo custom panelem.
04
Sequencing
Illumina-kompatibilní knihovny pro krátké čtení.
05
Analysis
Variant calling s UMI deduplikací pro detekci ≤ 0,1 % VAF.
Naměřené hodnoty
Srovnání s konkurenčními produkty
Grafy srovnání Twist cfDNA TrueAmp kitu s konkurenčními kity K, Q, W, N na 15 ng vstupních standardech.
Chybovost na úrovni knihoven bez PCR
Chybovost substitučních variant amplifikace Twist TrueAmp odpovídá metodám bez PCR — bez kompromisu v rychlosti postupu.
Citlivost detekce 0,25 % VAF
Vyšší citlivost a přesnost detekce variant na úrovni 0,25 % VAF napříč různými typy substitucí — kritické pro liquid biopsy.
Komplexita knihovny s UMI
Vyšší komplexita knihovny (s i bez UMI odstranění duplicit) — zachová více unikátních molekul pro spolehlivou analýzu duplex sekvenováním.
Hlavní aplikace
Co dokážete s cfDNA TrueAmp
Liquid biopsy
Analýza cfDNA pro včasný záchyt nádorů — detekce ctDNA s nízkým VAF (≤ 0,1 %) i ve složitých klinických vzorcích.
MRD monitoring
Sledování reziduálního onemocnění v plazmě. Kompatibilní s panelem Twist MRD Express pro detekci relapsu v reálném čase.
Pan-cancer screening
Vyšetření širokého spektra solidních nádorů z jediné krevní zkumavky. Kompatibilní s Twist cfDNA Pan-Cancer Reference Standard v2.
Duplex sekvenování
Vysoce citlivá detekce s UMI duplex sekvenováním — kombinuje obě vlákna DNA a razantně snižuje chybovost.
Onkologie CGP
Komplexní genomické profilování — SNV, indely, CNV i biomarkery ze stejné knihovny.
NIPT a fetální DNA
Kompatibilní postup pro analýzu fetální cfDNA z krve matky — vhodné pro výzkumné NIPT studie.
Pojďme začít
Chcete vyzkoušet cfDNA TrueAmp Kit?
Dejte nám vědět, jakou máte aplikaci a rádi s Vámi zkonzultujeme možnosti.