Twist Bioscience

Custom panely — target enrichment přesně na míru

Custom NGS panely od Twist Bioscience nabízejí plnou kontrolu nad sekvenovanými cíli. dsDNA próby s proprietárním návrhem pro DNA, RNA i metylační workflow. Vyšší uniformita pokrytí, vysoký on-target rate a dodání do 3–4 týdnů.

  • > 1M Próbů v jednom panelu
  • 3–4 Týdny dodací doba
  • 99,5 % Průměrná uniformita
  • DNA/RNA i metylační workflow
Hlavní výhody

Tři důvody, proč Twist custom panely

Flexibilita

Panel můžete upravovat s každou objednávkou — přidat geny, regiony, varianty. Žádný „freeze" designu, žádné dodatečné poplatky za změny.

Maximální podpora

Náš tým aplikačních specialistů 3GENES s vámi vytvoří návrh panelu, provede vás celou přípravou knihoven a pomůže vám s analýzou dat.

Rychlost dodání

Dodací doba 3–4 týdny, takže panel dostanete obratem a urychlíte projekt.

Srovnání s konkurencí

Twist vs. tradiční target enrichment

Tradiční panely od konkurence často trpí nerovnoměrným pokrytím, redundancí prób a vysokým off-target ratem. Twist tyto problémy řeší ve všech těchto bodech.

Kritérium
Twist
Tradiční panely
Design prób
Per-target screening — pro každý cíl vybíráme nejlepší probu z mnoha kandidátů
Univerzální „one size fits all" design, často centrovaný na cíl
Uniformita pokrytí
Vyšší (referenčně 99,5 %)
Nižší, špičky a propady
On-target rate
Vyšší díky precizní syntéze a screeningu
Nižší kvůli off-target hybridizaci
Customizace
Plně customizovatelné při každé objednávce — bez poplatků za re-design
Často fixní obsah a change orders s příplatkem
Dodací doba
3–4 týdny
Často 6+ týdnů
Velikost panelu
Od jednotek po > 1 000 000 próbů
Omezený rozsah velikostí
QC
NGS QC validace u každé šarže
Variabilní QC metody
Jak to funguje

Twist Custom NGS panely

Podívejte se na workflow Twist custom panelů a klíčové výhody silicon platformy.

Typy panelů

DNA, RNA, metylační a long‑read panely

DNA

DNA Custom Panely

Pro genomickou analýzu — SNP, fúze, strukturní varianty, CNV, indely. „Probe shifter" technologie vybírá nejlepší probu pro každý cíl a minimalizuje off-target capture.

Twist DNA panel — probe shifter technology vybírá nejlepší probu
  • SNP, fúze, CNV, indely
  • Probe shifter technology — best probe per target
  • Minimalizuje off-target capture
  • Vhodné pro onkologii, hereditární choroby, klinický výzkum
RNA

RNA Custom Panely

Cílené obohacení RNA knihoven převedených na cDNA. Próby jsou navrženy s ohledem na strukturu exonů — zachytí fúzní transkripty, sestřihové varianty i jednotlivé izoformy. Próby přesahující exonové hranice umožňují rozlišit celé transkripty v plné délce.

Twist RNA panel — návrh prób s ohledem na strukturu exonů
  • Obohacení cDNA knihoven
  • Návrh prób s ohledem na strukturu exonů
  • Próby přesahující exonové hranice — záchyt fúzí
  • Sestřihové varianty a rozlišení izoforem
Metylace

Metylační Custom Panely

Čtyři typy próby pro každý cíl — plně metylovaný, plně nemetylovaný, sense a antisense. Zachová metylační vzorec během hybridizace a udrží vysokou uniformitu.

Twist methylation panel — 4 typy próby pro každý cíl
  • 4 typy próby na cíl
  • Plně i částečně metylované varianty
  • Sense i antisense pokrytí
  • Vysoká uniformita po bisulfitové konverzi
Long-read

Long-read Custom Panely

Cílené obohacení pro long-read platformy (PacBio HiFi, ONT). Delší próby a specifický návrh pro dlouhé fragmenty — přístup k oblastem, které short-read technologie nedosáhne (repetice, pseudogeny, strukturní varianty).

Pokrytí genu GBA: short-read WGS má výpadek pokrytí, long-read HiFi data z Twist panelu pokrývají oba haplotypy celé
  • Kompatibilní s PacBio HiFi a ONT
  • Delší próby pro dlouhé fragmenty
  • Přístup do repetitivních oblastí a pseudogenů
  • Ideální pro strukturní varianty a haplotyping
Hlavní aplikace

Co řešit s Custom panely

Onkologický výzkum

Cílené panely pro somatické varianty, fúze a CNV. MRD detekce z cfDNA. TMB, MSI i HRD biomarkery.

Vzácná onemocnění

Hereditární choroby, onemocnění způsobená expanzí repetic i mitochondriální nemoci.

Liquid biopsy

Cell-free DNA panely pro detekci nízko frekventních variant. MRD monitoring v reálném čase a screening dědičných onkologií.

Imunologie a TCR/BCR

Custom panely pro analýzu imunorepertoáru, oblastí MHC a HLA typizaci. Návrh panelů zaměřených na lokusy TCR/BCR s využitím sond pokrývajících spojovací oblasti (tzv. junction-spanning probes).

Agrigenomika

Custom panely pro analýzu polyploidních genomů (např. u šlechtění borůvek), detekci rostlinných patogenů a cílenou analýzu agronomicky významných lokusů.

Klinická diagnostika

Panely pro klinické aplikace – farmakogenomiku, genetické predispozice i diagnostiku infekčních onemocnění.

Pojďme začít

Uvažujete nad custom panelem?

Vytvoření návrhu je bezplatné a nezávazné. Dejte nám vědět, rádi vám s návrhem panelu pomůžeme.