Jednoduchý postup · sekvenování ve velkém

seqWell — příprava NGS knihoven na destičce pro velké počty vzorků

seqWell je americký výrobce kitů na přípravu NGS knihoven přímo na destičce. Staví je na vlastní transpozáze TnX™, díky které knihovna vzniká za jeden den a normalizace vzorku je součástí protokolu. Kity běží na 96 i 384 pozicích, od desítek po tisíce vzorků měsíčně.

Vyžádat konzultaci Prohlédnout portfolio

384 Pozic na destičce, škáluje z 96
1 den Celá příprava knihovny
85 % Čtení v cíli po optimalizaci
95–99 % Úspěšnost přípravy

O společnosti

NGS knihovny připravené na destičce

seqWell staví kity pro laboratoře, které ročně připraví tisíce sekvenačních knihoven. Cílem je odstranit rutinní pipetování a normalizaci každého vzorku zvlášť. Každý kit je vyladěný na konkrétní typ vstupu, počet vzorků a navazující aplikaci.

Platforma zvládá krátká i dlouhá čtení, nízké i běžné vstupy, kolonky i hluboké destičky. Dvoudenní protokoly se tím zkracují na jeden den. Kroky kontroly kvality a normalizace se přesouvají na úroveň celé destičky, takže technik obslouží 96 vzorků stejně snadno jako osm.

Technologie

Transpozáza TnX™ a práce na destičce

TnX™ je nová generace tagmentační transpozázy. Proti standardním enzymům Tn5 dává rovnoměrnější pokrytí, vyšší výtěžek i pestřejší knihovnu. Ve spojení s protokolem na destičce odpadá normalizace jednotlivých vzorků — vzorky se slučují ve vyváženém poměru rovnou z destičky.

Kit vyladěný na aplikaci

Každý kit je vyladěný na konkrétní použití — mikrobiální genomy, zemědělství, jednobuněčné metody, WGS. Bez univerzálních kompromisů.

Knihovna za jeden den

Tradiční dvoudenní protokol se zkracuje na jeden den. Kratší cesta k datům a méně směn na jeden běh.

Normalizace v protokolu

Normalizace probíhá přímo na destičce. Odpadá měření každého vzorku na Qubitu nebo TapeStation před sloučením.

Z 96 na 384 pozic

Stejný protokol běží na 96jamkové i 384jamkové destičce. Kapacita se zečtyřnásobí bez změny SOP a bez přeškolení.

Rovnoměrnější pokrytí

TnX™ dává rovnoměrnější pokrytí než standardní enzymy Tn5. Méně výpadků a čistší navazující analýza.

Méně chyb obsluhy

Méně samostatných pipetovacích kroků a méně mezikroků kontroly kvality. Úspěšnost přípravy 95–99 %.

Aplikace

Kam seqWell dodává knihovny

WGS s nízkým pokrytím

Celogenomové screeningové běhy s desítkami až tisíci vzorky — populační studie, imputace, určování původu.

Mikrobiální genomika

Celogenomové sekvenování bakterií, sledování kmenů a dohled nad patogeny. Velký počet vzorků za nízkou cenu.

Zemědělská genomika

Panely pro rostliny i hospodářská zvířata — GBS a WGS pro šlechtitelské programy. AgriPrep vznikl přímo pro tuto oblast.

Plazmidy a amplikony

Ověřování plazmidů, sekvenování amplikonů a kontrola editace genomu. Rychlé kontrolní běhy bez dlouhých protokolů.

Dohled nad SARS-CoV-2

Sledování patogenů s ověřenou opakovatelností. Protokoly použité v epidemiologických studiích během pandemie.

Jednobuněčné metody a protilátky

Knihovny ve velkých sériích pro jednobuněčné metody a vývoj protilátek.

Portfolio

Klíčové produkty seqWell

Krátká čtení

ExpressPlex™ 2.0

Výhody:: Sloučené kroky, rychlejší kontrola kvality, méně chyb obsluhy, knihovna za jeden den.
Využití:: Pro objemné projekty na Illumině — populační studie, celogenomové sekvenování bakterií, zemědělské panely.

Dlouhá čtení

LongPlex™

Výhody:: Multiplexování pro platformy s dlouhými čteními. Jeden běh pokryje desítky vzorků bez samostatné přípravy.
Využití:: Pro projekty na PacBio a Oxford Nanopore s velkým počtem vzorků — transkriptom v plné délce, izoformy, strukturní varianty.

Multiplexování

MosaiX™

Výhody:: Škálovatelné indexování s velkou sadou čárových kódů. Ani u tisíců vzorků kódy nekolidují.
Využití:: Pro kombinatorické projekty a běhy, kde na jednom čipu jedou stovky vzorků.

Zemědělství

AgriPrep™

Výhody:: Protokol nezávislý na druhu. Snese nízké vstupy i méně čisté vzorky z rostlin a zvířat.
Využití:: Šlechtitelské programy, populační genomika plodin a hospodářských zvířat, výběr podle markerů.

Na míru

Tagify™ (na míru / i5 UMI / TnX Universal)

Výhody:: Transpozáza nabitá vlastní sadou čárových kódů, verze s UMI pro počítání molekul a varianta s univerzálním adaptérem.
Využití:: Pro laboratoře s vlastní strategií kódování, korekcí chyb přes UMI a nároky na kompatibilitu napříč platformami.

Kontrola

PhiRx™

Výhody:: Indexovaná kontrola vyvažující barvy. Stabilizuje určování bází u knihoven s nízkou komplexitou.
Využití:: Přidává se do běhů s nízkou komplexitou (amplikony, jednolokusové panely), aby neklesla kvalita čtení.

Pojďme začít

Zajímá vás seqWell pro vaši laboratoř?

Pomůžeme vybrat kit podle vaší aplikace, počtu vzorků a sekvenátoru. Konzultace je nezávazná, v ČR i SR, a můžeme nabídnout vzorky na vyzkoušení.

Vyžádat konzultaci Zpět na zastoupení